คุณสมบัติพิเศษของวิงกันดั้มซีโร่ก็คือซีโร่ซิสเต็ม(ZERO = Zoning and Emotional Range Omited)
ซึ่งเป็นระบบที่ประมวลผลความเป็นไปได้ทั้งหมดของเหตุการณ์ในอนาคตจากสภาพแวด
ล้อมและสภาพจิตใจของนักบินแล้วจึงส่งข้อมูลสู่สมองของนักบินโดยตรง
นักบินของวิงกันดั้มซีโร่จึงสามารถคำนวณเหตุการณ์ในอนาคตได้
แต่เนื่องจากการใช้งานระบบนี้นั้นสภาพจิตใจของนักบินจะอยู่ในสภาพตึงเครียด
มากเพราะจิตใจที่วอกแวกจะทำให้ภาพอนาคตที่ซีโร่ซิสเต็มคำนวณออกมานั้นผิด
เพี้ยนไปได้ ซึ่งผลที่ออกมานั้นมักจะมีภาพความตายของนักบินอยู่ด้วยเสมอ
การใช้งานซีโร่ซิสเต็มเป็นเวลานานจึงอาจทำให้เสียสติได้
วิงกันดั้มซีโร่เป็นโมบิลสูทที่นักวิทยาศาสตร์ทั้งห้าคือ ด็อกเตอร์ J,
โปรเฟสเซอร์ G, ด็อกเตอร์ S, อินสทรัคเทอร์ H และ มาสเตอร์ O
ได้ร่วมกันพัฒนาเพื่อใช้ต่อสู้กับองค์กรลับ OZ (Organization of Zodiac)
แต่เนื่องจากพลังในการต่อสู้ของวิงกันดั้มซีโร่นั้นสูงเกินไปจนเป็นอันตราย
นักวิทยาศาสตร์ทั้งห้าจึงได้ยกเลิกแผนการสร้างวิงกันดั้มซีโร่และได้แยกย้าย
กันไปสร้างกันดั้มของตัวเอง ทว่าในภายหลังคาเทอร์ ลาบาบา วินเนอร์
นักบินของกันดั้มแซนด์ร็อคก็ได้ไปเจอแบบแปลนของวิงกันดั้มซีโร่และสร้างขึ้น
มา เนื่องจากความโกรธแค้นที่พ่อถูกชาวโคโลนีฆ่า
คาเทอร์จึงถูกซีโร่ซิสเต็มทำให้บ้าคลั่งทำลายทุกอย่าง
ก่อนจะได้สติหลังจากที่ยิงโจมตีโมบิลสูทไวย์เอตของโทรวา
บาร์ตันผู้เป็นเพื่อนสนิท
คาเทอร์ได้ทิ้งวิงกันดั้มซีโร่ไว้บนดวงจันทร์เพื่อใช้ระบบทำลายตัวเองของโม
บิลสูทเมอคิวเรียสทำลายแต่ล้มเหลว และวิงกันดั้มซีโร่ก็ถูกพวก OZเก็บไป
พวก
OZได้พยายามใช้วิงกันดั้มซีโร่แต่ไม่มีนักบินที่มีความสามารถพอจะใช้งานซี
โร่ซิสเต็มได้อย่างมีประสิทธิภาพจึงเตรียมทำลายทิ้งแต่ได้ตกไปอยู่ในการครอบ
ครองของเซคส์ มาควิส หลังการต่อสู้กับกันดั้มเอเปี้ยนของฮีโร่ ยุยและทั้งคู่ได้แลกเปลี่ยนโมบิลสูทกัน ฮีโร่ ยุยได้ใช้วิงกันดั้มซีโร่เป็นโมบิลสูทประจำตัวจนจบเนื้อเรื่อง
